内含子和外显子的发现是过去15年遗传学中最重要的发现之一。分裂基因被发现时，DNA序列之间缺乏联系，在实验中发现。DNA-mRNA杂交。对于所有新的mRNA，它们必须由RNA聚合酶转录。
转录开始于DNA上的启动子序列并向下进行，因此mRNA的核苷酸序列与DNA的核苷酸序列互补。在真核生物中，mRNA在转运到细胞质进行翻译之前在细胞核中进行处理。为了使mRNA成为真正发挥功能的RNA，它必须经过几个阶段的修饰。
首先，当mRNA产生时，RNA的5¹端通过一个三磷酸键连接一个7-甲基鸟苷残基，这个键被称为G-cap。G-cap是翻译的必要条件。
核糖体的亚基识别g -帽，然后找到起始密码子开始翻译。随着mRNA转录完毕，Poly A尾部被加到3¹端。当两端被放置时，mRNA就变成了pre-mRNA。
pre-mRNA由剪接区和非编码区组成。pre-mRNA分子比编码蛋白质所需的mRNA分子长得多。不编码氨基酸的区域;Aa，分散在编码区域。这些基因被编码区分开，称为外显子，是表达区的简称;在外显子之间存在被称为内含子的非编码区域。在mRNA翻译之前，内含子必须被剪切掉。
剪接对细胞来说是一个复杂的过程。它必须找到主转录本中的每一个内含子。一个mRNA平均由8到10个内含子组成，有些甚至包含16个内含子。外显子和内含子一样，也是分开的。它们的一些密码子可能被内含子分裂，因此单个氨基酸的信息可能相隔一定距离。剪接发生在细胞核中，也可以发生在细胞质和线粒体中。插入子剪接后，g -帽和Poly A尾巴仍留在mRNA上。
一个基因可以通过可变剪接为多个蛋白质编码。发现一条单链编码20种不同的蛋白质，这取决于外显子的组装方式。不同的剪接组合以组织特有的方式进行调节。
大多数转录的DNA都是内含子。当内含子被消除时，基因转录本中99%的信息都被破坏了，因为外显子只被翻译。大多数基因都有内含子。只有少量的生物体没有内含子。与较小的真核生物相比，较大的真核生物往往具有更大、数量更多的内含子。
在mRNA的外显子-内含子连接处有一个核酸序列，允许内含子剪接。据了解，大多数基因在5¹剪接位点有一个GU，在3¹剪接位点有一个AG。
这被称为GU-AG规则剪接酶，通过称为snRNP或snurps的核糖核蛋白识别这些位点。snurps是由少于300个核苷酸的小的核RNA片段形成的，称为snRNAs。当一个RNA分子被转录时，四个SNURP连接到它上，并结合成一个大的剪接体。丰富的SNRNA催化基因的切割和剪接。
在自分裂的内含子中，发夹结构使内含子的末端靠近分支点。然后内含子自身催化连接两个外显子的环的形成。自剪接内含子与需要剪接体的内含子的区别在于，非自剪接内含子可以分裂任何大小的内含子。
这有助于生物体在突变中存活。当突变形成时，有时自剪接内含子会失去其发夹结构，而不允许自己剪接。
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